浙大血研所郭国骥组 | 高通量单细胞RNA测序绘制人多能干细胞分化图谱

发布者:于晓虹发布时间:2018-04-16浏览次数:808


    继浙江大学郭国骥团队于2018年2月在Cell 杂志发表重磅文章后,2018年4月郭教授课题组又在著名期刊《Genome Biology》上发表文章《Mapping human pluripotent stem cell differentiation pathways using high throughput single-cell RNA-sequencing》。



     在该论文中,郭国骥团队基于优化后的Flugigm公司的C1高通量单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法,通过对4822个scRNA-seq数据的分析(其中包括2636个EB样本(683个第四天EB和1953个第8天EB),1491个Naïve样H9和695个Primed H9细胞样本),绘制了人多能干细胞(hPSC)早期分化的细胞状态图谱,涵盖多种细胞谱系,包括神经,肌肉,内皮,基质,肝脏和上皮细胞。


  

    同时,研究者将初始态的H9细胞(primed H9 cells)重编程为幼稚样H9细胞(naïve-like H9 cells),通过数据分析发现,在功能上幼稚样H9比初始态H9细胞具有更高潜能分化为造血细胞谱系

 



    总体上来看,该研究构建了一个单细胞水平分化的hPSC分化图谱,为早期胚胎发育提供了新的见解和证据,并可以在此基础上建立和优化向造血、心肌和神经等重要谱系分化的方法,争取早日实现在临床上的应用。